保险公司不认司法鉴定不影响判决。依据《民事诉讼法》，法院委托的鉴定结果有法律效力，会按此判决。不及时处理可能导致权益受损，影响赔偿。
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常见处理方式有申请法院强制执行或重新鉴定。若鉴定系法院委托，可直接申请强制执行；若存在疑虑，可申请重新鉴定，但需法院批准。
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保险公司不认鉴定可这样处理：1. 若鉴定为法院委托，直接持鉴定结果向法院申请强制执行；2. 若对鉴定有异议，向法院申请重新鉴定，并提供新证据或理由；3. 在处理过程中，保持与保险公司沟通，尽量协商解决，避免不必要的法律纠纷。